Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Atp8b3Q6UQ17 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Atp8b3Q6UQ17 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Atp8b3Q6UQ17 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atp8b3Q6UQ17 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Atp8b3Q6UQ17 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Atp8b3Q6UQ17 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Atp8b3Q6UQ17 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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Atp8b3Q6UQ17 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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