Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga3Q62470 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga3Q62470 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga3Q62470 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga3Q62470 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itga3Q62470 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Itga3Q62470 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Itga3Q62470 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms