Protein–RNA interactions for Protein: Q62433

Ndrg1, Protein NDRG1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg1Q62433 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ndrg1Q62433 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ndrg1Q62433 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ndrg1Q62433 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ndrg1Q62433 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ndrg1Q62433 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ndrg1Q62433 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ndrg1Q62433 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ndrg1Q62433 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ndrg1Q62433 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ndrg1Q62433 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ndrg1Q62433 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ndrg1Q62433 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndrg1Q62433 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ndrg1Q62433 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg1Q62433 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ndrg1Q62433 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg1Q62433 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ndrg1Q62433 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg1Q62433 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg1Q62433 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg1Q62433 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg1Q62433 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg1Q62433 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg1Q62433 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg1Q62433 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ndrg1Q62433 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms