Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprrQ62132 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprrQ62132 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprrQ62132 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprrQ62132 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprrQ62132 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprrQ62132 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtprrQ62132 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtprrQ62132 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtprrQ62132 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprrQ62132 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtprrQ62132 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprrQ62132 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprrQ62132 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprrQ62132 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprrQ62132 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprrQ62132 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprrQ62132 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprrQ62132 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprrQ62132 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtprrQ62132 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PtprrQ62132 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprrQ62132 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprrQ62132 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprrQ62132 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtprrQ62132 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PtprrQ62132 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PtprrQ62132 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PtprrQ62132 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PtprrQ62132 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PtprrQ62132 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PtprrQ62132 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms