Protein–RNA interactions for Protein: Q16625

OCLN, Occludin, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCLNQ16625 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCLNQ16625 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms