Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gata4Q08369 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gata4Q08369 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms