Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CENPEQ02224 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms