Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CckbrP56481 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CckbrP56481 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CckbrP56481 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CckbrP56481 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CckbrP56481 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CckbrP56481 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CckbrP56481 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CckbrP56481 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CckbrP56481 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CckbrP56481 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CckbrP56481 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CckbrP56481 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CckbrP56481 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CckbrP56481 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CckbrP56481 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CckbrP56481 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CckbrP56481 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CckbrP56481 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CckbrP56481 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CckbrP56481 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CckbrP56481 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CckbrP56481 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
CckbrP56481 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CckbrP56481 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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