Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rab11bP46638 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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