Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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NdnP25233 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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NdnP25233 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NdnP25233 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NdnP25233 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NdnP25233 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NdnP25233 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NdnP25233 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NdnP25233 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NdnP25233 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NdnP25233 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NdnP25233 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NdnP25233 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NdnP25233 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NdnP25233 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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