Protein–RNA interactions for Protein: P0C8K7

Smim1, Small integral membrane protein 1, mousemouse

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Length 78 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim1P0C8K7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim1P0C8K7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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