Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb2O55203 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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