Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hps1O08983 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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