Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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