Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRQQ9UMZ3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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