Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Stx12Q9ER00 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms