Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sil1Q9EPK6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sil1Q9EPK6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sil1Q9EPK6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sil1Q9EPK6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sil1Q9EPK6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sil1Q9EPK6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sil1Q9EPK6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sil1Q9EPK6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sil1Q9EPK6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sil1Q9EPK6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sil1Q9EPK6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sil1Q9EPK6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sil1Q9EPK6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sil1Q9EPK6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sil1Q9EPK6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sil1Q9EPK6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms