Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne8Q9DC53 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms