Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem239Q9DA47 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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