Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem88Q9D0N8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms