Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms