Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms