Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca3Q99M54 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca3Q99M54 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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