Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms