Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00301Q8NCQ3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms