Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms