Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms