Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Ss18Q62280 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ss18Q62280 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ss18Q62280 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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