Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr1d1Q3UV55 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms