Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNAPC1Q16533 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNAPC1Q16533 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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