Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SRSF4Q08170 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF4Q08170 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms