Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn18P56857 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms