Protein–RNA interactions for Protein: P48615

Wnt11, Protein Wnt-11, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wnt11P48615 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Wnt11P48615 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Wnt11P48615 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms