Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx2O70340 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms