Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChkaO54804 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChkaO54804 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ChkaO54804 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChkaO54804 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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