Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH5

Trim10, Tripartite motif-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim10Q9WUH5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim10Q9WUH5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim10Q9WUH5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms