Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF8Q9UPP1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms