Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfwd2Q9R1A8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms