Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms