Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Nrif1Q923B3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Nrif1Q923B3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Nrif1Q923B3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nrif1Q923B3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nrif1Q923B3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nrif1Q923B3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Nrif1Q923B3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Nrif1Q923B3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Nrif1Q923B3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Nrif1Q923B3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Nrif1Q923B3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Nrif1Q923B3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nrif1Q923B3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms