Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLIP4Q8N3C7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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CLIP4Q8N3C7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CLIP4Q8N3C7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CLIP4Q8N3C7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CLIP4Q8N3C7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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