Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Kcnf1Q7TSH7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnf1Q7TSH7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms