Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms