Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pitpnm3Q3UHE1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms