Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zyg11bQ3UFS0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zyg11bQ3UFS0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms