Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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SYCP1Q15431 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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SYCP1Q15431 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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SYCP1Q15431 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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SYCP1Q15431 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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SYCP1Q15431 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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SYCP1Q15431 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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SYCP1Q15431 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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SYCP1Q15431 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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SYCP1Q15431 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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