Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pglyrp4Q0VB07 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pglyrp4Q0VB07 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms