Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDR1Q08345 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDR1Q08345 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms