Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUMO3P55854 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms