Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITPNBP48739 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms